Villa Schifanoia fu edificata sui resti di un casale della villa di proprietà dei Palmieri che si trova poco distante. Come dice il nome, si tratta di un luogo dedicato al piacere e allo svago (schifanoia significa "schivare la noia").

Il nucleo principale della villa fu costruito nel XV secolo e rimase di proprietà della famiglia Cresti fino al 1550, anno in cui l`edificio fu venduto a Bartolomeo di Bate di Zaccheria.

Dopo aver subito vari passaggi di proprietà, nel 1927 la villa fu acquistata dall`americano Myron Taylor, ambasciatore statunitense presso il Vaticano. L`ambasciatore fece restaurare la villa e trasformò il parco in uno splendido giardino all`italiana.
In precedenza erano state aggiunte una cappella gentilizia e l`ala nord-occidentale della villa, conosciuta anche come la "villetta".

Alla morte di Taylor la villa passò nelle mani della Santa Sede, che la adibì a collegio per giovani americane che si trovavano a Firenze per motivi di studio. Nel 1986 la villa è stata acquistata dallo stato italiano e oggi ospita il prestigioso Istituto Universitario Europeo.