De villa van Careggi is één van de oudste landgoederen van de Medici. Plattelandswoning net als de villa van Cafaggiolo en het kasteel van Trebbio, is de villa van Careggio de dichtstbijzijnde van Florence en dus het hart van de zaken van de familie.

Het was Giovanni di Bicci de’ Medici, stamvader van de belangrijke florentijnse familie, die de villa in 1417 kocht. Na zijn dood (1429) erfde Cosimo il Vecchio het landgoed en gaf aan Michelozzo de opdracht de villa te restaureren.

In de villa van Careggi werd Lorenzo il Magnifico geboren en stierf er, die het tevens koos als zijn favoriete verblijf. En het is precies in de villa van Careggi waar Lorenzo zijn vriendenschrijvers ontving, leden van de Neoplatonische Accademie. Hier verbleven bijvoorbeeld Marsilio Ficino, Agnolo Poliziano en Pico della Mirandola.

Als in het tijdperk van Lorenzo il Magnifico de villa één van de centra van het leven van het artistieke en culturele florentijnse leven was, met de dood van Lorenzo begon een periode van verwaarlozing, en de villa werd meerdere malen van eigenaar gewisseld en werd in 1529 door een brand beschadigd.

Na enkele resatauratiewerkzaamheden opgedragen door Hertog Alessandro bij de terugkeer van de Medici in Florence, ondernam de Kardinaal Carlo de’ Medici in 1615 een groot restauratieproject van de tuin en de internen van de villa.

Met de komst van de Lorena, in 1779, werd de villa verkocht aan de familie Orsi die het weer verder verkocht aan Francis Sloane in 1848. Sloane was een liefhebber van plantkunde en plantte in de tuin een serie zeldzame en exotische planten.

In de tweede helft van de negentiende eeuw veranderde de villa nogmaals verschillende keren van eigenaar en tenslotte werd het in 1936 gekocht door het Ziekenhuis van Santa Maria Nuova.