Villa Schifanoia werd gebouwd op de resten van een woning van de villa dat eigendom was van de Palmieri dat zich niet ver ervandaan bevindt. Zoals de naam al zegt, is het een plaats gewijd aan het plezier en het vermaak (schifanoia betekend “de verveling vermijden).

De hoofdkern van de villa werd gebouwd in de XVe euw en bleef eigendom van de familie Cresti tot 1550, het jaar waarin het gebouw verkocht werd aan Bartolomeo di Bate di Zaccheria.

Na van verschillende eigenaren te hebben gewisseld, werd de villa in 1927 gekocht door de amerikaan Myron Taylor, een ambassadeur uit de Verenigde Staten in het Vaticaan. De ambassadeur liet de villa restaureren en veranderde het park tot een schitterende italiaanse tuin.
In het verleden werden een adellijke kapel en de noord-oostvleugel aan de villa toegevoegd, ook bekend als de “villetta”.

Na de dood van Taylor kwam de villa in handen van de Heilige Zetel, die het gebruikte als college voor de jonge amerikanen die zich in Florence bevonden voor studiemotieven. In 1986 werd de villa gekocht door de italiaanse staat en vandaag de dag ontvangt het het prestigieuze Europese Universitaire Instituut.